Le lycée du Pflixbourg dans le respect de sa mission d'inclusion a constitué au fil des ans une équipe pour accompagner les élèves à besoins éducatifs particuliers et des élèves en difficultés.
Cette équipe se compose de l’infirmière scolaire, Mme Helderlé, en lien avec les professeurs principaux, de sept AESH (accompagnants des élèves en situation de handicap), d'une enseignante coordinatrice, et d'un enseignant référent M. Haefflinger.
L'équipe est en charge des Plans d’Accompagnement Personnalisé PAP, des Plans Personnalisés de Scolarité PPS, ainsi que de l’accompagnement pour la constitution des dossiers de demandes d’aménagements pour les examens.
Une salle est spécialement dédiée aux AESH afin qu'ils puissent recevoir et accompagner les élèves. Du matériel spécifique est en cours d'acquisition : jeux - affiches - outils... et des formations sont régulièrement proposés afin d'améliorer l'accompagnement.